Le 4 avril 1925, c’est la catastrophe au village. En moins de deux heures, l’église de bois part en fumée. Plus rien ne subsiste, hormis quelques objets liturgiques que de braves paroissiens ont pu extirper des flammes^[1]. C’est un dur coup pour la jeune paroisse fondée en 1893, elle qui a vu son presbytère être lui aussi la proie des flammes quelques années auparavant^[2].

Dès le 19e siècle, des familles s’établissent aux 4e et 5e rangs de Deschambault et doivent parcourir « des kilomètres sur des chemins difficilement praticables pour se rendre à l’église de Deschambault, la plus près^[3] ». De plus, faute de moyens de communication, « c’est aux portes des églises que se lisaient les avis publics^[4] ». Pour remédier au problème, un dénommé Gilbert Frenette offre un terrain pour y construire un temple. La paroisse en devenir lui est tellement reconnaissante que pour l’en remercier, elle se place sous le patronage de saint Gilbert en son honneur.

Ce n’est qu’en 1893 que les paroissiens voient enfin s’ériger l’église dessinée par Zéphirin Perreault (1834-1906), architecte de Deschambault. C’est Alfred Giroux (1845-1909), issu d’une famille de bâtisseurs de Saint-Casimir, qui obtient le mandat de la construction et en octobre de la même année, l’édifice est déjà suffisamment avancé pour qu’on y installe le chemin de croix offert par Zéphirin Bouillé, pilote de Deschambault. Toutefois, il faudra attendre pas moins de neuf ans pour que le parachèvement de l’édifice religieux soit complété.

Pendant les travaux de construction, les paroissiens n’étaient pas pour autant privés d’offices religieux : les messes sont dites dans la vieille salle d’école et chez la famille Létourneau, où le curé logera jusqu’à ce que le presbytère soit fin prêt en 1894. D’ailleurs, c’est l’archevêché qui se chargera de faire construire le presbytère, reprochant à certains paroissiens leur manque de « bonne volonté ».

À la suite de l’incendie de 1925, la décision de reconstruire est immédiatement prise, mais cette fois-ci, l’église sera ignifuge. À l’instar d’églises européennes construites à la même époque, on lui donne une structure en acier et un plancher de béton armé, comme il devient alors de plus en plus fréquent dans l’architecture religieuse^[5]. L’architecte Philéas Myrand, qui 20 ans auparavant réalisait le décor intérieur de l’église de Saint-Casimir, dresse les plans d’une église de granit gris foncé veiné de rose que l’entrepreneur Joseph Collin prélève sur le coteau de Saint-Gilbert, en direction de Deschambault. Pour construire cette église, il en coûtera 25 000$ et pas un sou de plus puisqu’il s’agit du montant maximum accordé par l’ordonnance de Monseigneur Bégin (1840-1925) lui-même. Le cardinal est clair, il faut regarder à la dépense !

Quand vient le temps de planifier le parachèvement de l’édifice, qui sera complété trois ans plus tard (1928), le curé de l’époque, l’abbé Adélard Gagnon, s’implique personnellement et s’assure que les plans du décor intérieur de Gérard Morisset^[6] (1898‑1970), historien de l’art de Cap-Santé, soient dûment réalisés. Morisset prépare aussi les plans du mobilier liturgique, à l’exception des autels, soit la chaire, le banc d’œuvre, les stalles et les boiseries du chœur, la table de communion, les retables des autels latéraux, les bancs et les fonts baptismaux. Les cloches, achetées à la maison C. Émile Morissette^[7] de Québec et nommées Saint-Gilbert (la), Marie (si) et Joseph (do#), seront bénies en 1930. Seul s’ajoutera, au fil des ans, l’orgue Hammond acquis à la fin des années 1950, qui profitera de l’électricité installée quelques années avant, en décembre 1945.

Dans les années 1970, l’église subira quelques modifications, lui faisant perdre ses boiseries dans le chœur et les fonts baptismaux. De plus, on déménagera dans les deux oratoires de la façade – un baptistère et une chapelle des morts – les confessionnaux auparavant installés à l’avant de la nef. En cohérence avec la volonté de rendre plus modestes les églises à la suite de Vatican II, le dôme doré couronnant le maître-autel sera lui aussi retiré, bien que ce dernier conservera malgré tout son apparence d’origine. En 2001, une table d’autel réalisée par le sculpteur Luc Gagnon de Saint-Raymond sera ajoutée dans le chœur.

L’église de campagne, entourée de champs et de forêts, figure parmi les cinq plus récentes de Portneuf. Son implantation s’inscrit dans la continuité de la route principale et l’ilot paroissial comprend l’église, le presbytère, le cimetière adjacent ainsi que son calvaire de 1944^[8], œuvre de la maison T. Carli Petrucci de Montréal qui a aussi réalisé la statue du monument du Sacré-Cœur (1945) dont les plans ont été dessinés par le curé de l’époque, l’abbé Rosario Pouliot.